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Dejan Petkovic nasceu em 9 de outubro de 1972, em Majdanpek, Sérvia. Ele iniciou sua carreira profissional no Radni?ki Niš, clube de sua cidade natal, em 1991. Após duas temporadas impressionantes, ele se transferiu para o Vojvodina, onde permaneceu por mais duas temporadas.
Em 1995, Petkovic se juntou ao Real Madrid, um dos maiores clubes do mundo. Apesar de não ter sido titular regular, ele fez parte do elenco que conquistou o Campeonato Espanhol de 1996-97. Em 1998, ele se transferiu para o Sporting Lisboa, onde se tornou um jogador-chave, ajudando o clube a conquistar a Taça de Portugal em 1999-00.
Em 2002, Petkovic se transferiu para o Goiás Esporte Clube, no Brasil. Ele rapidamente se tornou um ídolo da torcida, liderando o clube à conquista do Campeonato Brasileiro Série B em 2003. Petkovic permaneceu no Goiás até 2006, marcando 55 gols em 150 partidas.
Após sua passagem pelo Brasil, Petkovic retornou à Europa, jogando pelo Al-Ittihad, da Arábia Saudita, e pelo OFI Creta, da Grécia. Ele se aposentou do futebol profissional em 2010.
Petkovic era um meio-campista habilidoso e versátil, conhecido por sua visão de jogo, passes precisos e chutes poderosos. Ele era um especialista em cobranças de falta e pênaltis.
Dejan Petkovic é considerado um dos maiores meio-campistas de sua geração. Ele conquistou títulos em vários países e deixou um legado duradouro no futebol brasileiro e mundial.